Ідентифікація та кількісне визначення амінокислот, що містяться в продуктах харчування людини та тварин, а також в біопрепаратах і навіть косметиці, є важливим для точної оптимізації та звітності про продукти в цих галузях. Кожен з цих продуктів виготовляється з використанням білків і пептидів - макромолекул, що складаються з довгих ланцюжків амінокислот. Для того, щоб точно проаналізувати їхній амінокислотний склад, ці амінокислоти необхідно відокремити від пептидних зв'язків. Зазвичай це робиться шляхом гідролізу за допомогою кислоти або основи. При використанні традиційних методів у рідкій фазі цей процес може зайняти від кількох годин до кількох днів. Мікрохвильові методи можуть прискорити цей гідроліз до амінокислот, що призводить до повної фрагментації менш ніж за годину, а також надає ряд переваг порівняно з традиційними методами.